Invitrogen™ SYTO™ Grønne fluorescerende nukleinsyrepletter

SYTO Grønne fluorescerende nukleinsyrepletter er cellegennemtrængende nukleinsyrefarvninger, der viser en stor fluorescensforøgelse ved binding af nukleinsyrer. De SYTO farvestoffer kan bruges til at farve RNA og DNA i både levende og døde eukaryote celler, såvel som i Gram-positive og Gram-negative bakterier.

De SYTO pletter deler flere vigtige egenskaber:
•Permeabilitet for stort set alle cellemembraner, inklusive pattedyrsceller og bakterier
• Høj molær absorptionsevne, med ekstinktionskoefficienter> 50.000 cm ^-1 M ^-1 ved synlige absorptionsmaksima
• Ekstremt lav iboende fluorescens, med kvanteudbytter typisk< 0,01, når det ikke er bundet til nukleinsyrer
• Kvanteudbytter, der typisk er> 0,4 når bundet til nukleinsyrer.

SYTO Grøn-fluorescerende nukleinsyrepletter excitation/emission:
•SYTO 9 —RNA 486/501 nm; DNA 485/498 nm
•SYTO 11 —RNA 510/530 nm; DNA 508/527 nm
•SYTO 12 —RNA 500/519 nm; DNA 499/522 nm
•SYTO 13 —RNA 491/514 nm; DNA 488/509 nm
•SYTO 14 —RNA 521/547 nm; DNA 517/549 nm
•SYTO 16 —RNA 494/525 nm; DNA 488/518 nm
•SYTO 21 —DNA 494/517 nm
•SYTO 24 —DNA 490/515 nm
•SYTO BC —RNA 487/504 nm; DNA 485/500 nm
•SYTO RNASelect— RNA 490/530 nm

SYTO farvestoffer adskiller sig fra hinanden i en eller flere karakteristika, herunder cellepermeabilitet, fluorescensforøgelse ved binding af nukleinsyrer, excitations- og emissionsspektre, DNA/RNA-selektivitet og bindingsaffinitet. De SYTO farvestoffer er kompatible med en række fluorescensbaserede instrumenter, der bruger laserexcitation eller en konventionel bredbåndsbelysningskilde (f.eks. kviksølv- og xenonbuelamper). Filtersæt, der er velegnede til billeddannelse af celler mærket med fluorescein (FITC), Alexa Fluor 488, eller GFP vil fungere godt til billeddannelse af celler farvet med SYTO Grønne nukleinsyrepletter.

SYTO nukleinsyrefarvninger er blevet brugt i forskellige applikationer fra farvning af DNA plettet på mikroarrays til farvning af levende og fikserede celler. De SYTO farvestoffer virker ikke udelukkende som nukleare pletter i levende celler og bør ikke sidestilles med DNA-selektive forbindelser såsom DAPI (kat. nr. D1306, D21490) eller Hoechst 33342 (Kat. nr. H1399, H3570), som farver kerner i levende dyreceller. Eukaryote celler inkuberet med SYTO farvestoffer viser generelt cytoplasmatisk eller mitokondriel farvning, såvel som nuklear farvning. De SYTO Grønne fluorescerende nukleinsyrepletter har vist sig at være værdifulde i en bred vifte af forskningsapplikationer såvel som brugt i flowcytometri og fluorescensmikroskopi.

Specifikke farvningsapplikationer til nogle af de SYTO Grønne fluorescerende nukleinsyrepletter:
De SYTO 9-farvning har vist sig at farve levende og døde Gram-positive og Gram-negative bakterier. Det er en del af LIVE/DEAD BacLight Bakterielle levedygtighedssæt (kat. nr. L7007, L7012, L13152).

De SYTO 11-farvning (kat.nr. S7573) er blevet brugt i forbindelse med time-lapse-mikroskopi til at undersøge spaltningsorienteringen af delende celler i den udviklende hjernebark.

De SYTO 13-farvning (kat.nr. S7575) er blevet brugt i kombination med propidiumiodid (kat.nr. P1304, P3566) til at overvåge glutamat-induceret nekrose i cerebellære granulaceller.

De SYTO 14-farvning (kat.nr. S7576) binder til cytoplasmatisk RNA, hvilket tillader dets anvendelse til sporing af RNA-granulatransport i levende neuroner.

Flere rapporter beskriver brugen af SYTO farvestoffer til påvisning af apoptose. En række af SYTO nukleinsyrefarvninger blev screenet for evnen til at skelne mellem apoptotiske og ikke-apoptotiske muse-thymocytter, og SYTO 16-farven (kat.nr. S7578) viste sig at være optimal til denne applikation. De SYTO 16-farvning er også blevet brugt med propidiumiodid til at differentiere levende og døde COS-7-celler med et laserbaseret scanningscytometer.

De SYTO BC Green Fluorescent Nucleic Acid Stain er en blanding af nogle af vores bedste SYTO farvestoffer til bakteriel farvning og er en komponent i bakterietællingssættet (kat.nr. B7277) til bakterietælling i flowcytometri.

De SYTO RNASelect Green Fluorescent Cell Stain er en cellegennemtrængende nukleinsyrefarvning, der selektivt farver RNA. Selvom den praktisk talt ikke er fluorescerende i fravær af nukleinsyrer SYTO RNASelect farven udviser lysegrøn fluorescens, når den er bundet til RNA (absorptions-/emissionsmaksima∼ 490/530 nm), men kun et svagt fluorescerende signal, når det er bundet til DNA. Det er blevet brugt til farvning af RNA-last i exosomer i både levende celleprøver og isolerede exosomer.

SYTO Grønt fluorescerende nukleinsyre-pletprøvesæt
De SYTO Green Fluorescent Nucleic Acid Stain Sampler Kit #1 indeholder vores samling af cellegennemtrængende, grøn-fluorescerende SYTO nukleinsyrepletter. Fordi farvestofferne kan udvise forskellig farvningsadfærd med forskellige væv og celler, kan det være nødvendigt at teste farvestofferne for at finde det optimale farvestof til en specifik anvendelse. Sættet indeholder 50 stkμ L hver af SYTO 11 –14, 16, 21 og 24 farvestoffer.

Enhver fysiologisk buffer mellem pH –7,0 8,0, inklusive PBS, kan bruges til at fortynde SYTO farvestoffer til farvningsopløsningen.