Invitrogen™ SYTO™ Grønne fluorescerende nukleinsyrepletter

SYTO Grønne fluorescerende nukleinsyrefarvninger er cellepermede nukleinsyrefarvninger, der viser en stor fluorescensforstærkning ved binding til nukleinsyrer. Farvestofferne SYTO kan bruges til at farve RNA og DNA i både levende og døde eukaryote celler samt i gram-positive og gramnegative bakterier.

Pletterne SYTO deler flere vigtige karakteristika:

• Permeabilitet for stort set alle cellemembraner, inklusive pattedyrsceller og bakterier
• Høj molar absorptionsevne med extinktionskoefficienter >50.000 ^{cm-1 M-1} ved synlige absorptionsmaksimum
• Ekstremt lav intrinsisk fluorescens med kvantudbytter typisk <0,01, når den ikke er bundet til nukleinsyrer
• Kvantum giver typisk >0,4, når det bindes til nukleinsyrer.

SYTO Grøn-fluorescerende nukleinsyrefarvninger excitation/emissionsbølgelængder

• SYTO 9—RNA 486/501 nm; DNA 485/498 nm
• SYTO 11—RNA 510/530 nm; DNA 508/527 nm
• SYTO 12—RNA 500/519 nm; DNA 499/522 nm
• SYTO 13—RNA 491/514 nm; DNA 488/509 nm
• SYTO 14—RNA 521/547 nm; DNA 517/549 nm
• SYTO 16—RNA 494/525 nm; DNA 488/518 nm
• SYTO 21—DNA 494/517 nm
• SYTO 24—DNA 490/515 nm
• SYTO BC—RNA 487/504 nm; DNA 485/500 nm
• SYTO RNASelect—RNA 490/530 nm

SYTO farvestoffer adskiller sig fra hinanden i en eller flere egenskaber, herunder cellepermeabilitet, fluorescensforstærkning ved binding af nukleinsyrer, excitations- og emissionsspektra, DNA/RNA-selektivitet og bindingsaffinitet. Farvestofferne SYTO er kompatible med en række fluorescensbaserede instrumenter, der bruger laserexcitation eller en konventionel bredbåndskilde (f.eks. kviksølv- og xenonbuelamper). Filtersæt, der er egnede til billeddannelsesceller mærket med fluorescein (FITC), 488 eller GFP, Alexa Fluor vil fungere godt til billeddannelsesceller farvet med SYTO Green Nucleic Acid Stains.

SYTO Nukleinsyrefarvninger er blevet brugt i forskellige anvendelser, fra farvning af DNA på mikroarrays til farvning af levende og fikserede celler. Farvestofferne SYTO fungerer ikke udelukkende som nukleære farvninger i levende celler og bør ikke sidestilles med DNA-selektive forbindelser som DAPI (Kat. nr. D1306, D21490) eller Hoechst 33342 (Kat. nr. H1399, H3570), som farver kerner i levende dyreceller. Eukaryote celler, der inkuberes med SYTO farvestoffer, viser generelt cytoplasmatisk eller mitokondriefarvet farvning samt nukleær farvning. De SYTO grønne fluorescerende nukleinsyrefarvninger har vist sig værdifulde i en bred vifte af forskningsapplikationer samt anvendt i flowcytometri og fluorescensmikroskopi.

Specifikke farvningsanvendelser for nogle af Green SYTO Fluorescerende Nukleinsyrefarvninger

9-farvningen SYTO har vist sig at farve levende og døde gram-positive og gram-negative bakterier. Det er en komponent i LIVE/DEAD BacLight Bacterial Viability Kits (Kat. nr. L7007, L7012, L13152).

11-bejdset SYTO (Kat. Nej. S7573) er blevet brugt sammen med timelapse-mikroskopi til at undersøge kløvningsorienteringen af delende celler i den udviklende hjernebark.

Den 13-plettede SYTO (Kat. Nej. S7575) er blevet brugt i kombination med propidiumiodid (Kat. nr. P1304, P3566) til at overvåge glutamatinduceret nekrose i cerebellære granulatceller.

14-pletten SYTO (Kat. Nej. S7576) binder til cytoplasmatisk RNA, hvilket muliggør dens anvendelse til at spore RNA-granulattransport i levende neuroner.

Flere rapporter beskriver brugen af SYTO farvestoffer til at opdage apoptose. En række SYTO nukleinsyrefarvninger blev screenet for evnen til at skelne mellem apoptotiske og ikke-apoptotiske musethymocytter, og 16-farvningen SYTO (Kat. nr. S7578) viste sig at være optimal til denne anvendelse. 16-farvningen SYTO er også blevet brugt sammen med propidiumiodid til at skelne mellem levende og døde COS-7-celler med et laserbaseret scanningscytometer.

SYTO BC Green Fluorescent Nucleinsyre Staining er en blanding af nogle af vores bedste SYTO farvestoffer til bakteriel farvning og er en del af Bacteria Counting Kit (Cat. Nej. B7277) til bakterieltælling i flowcytometri.

Green SYTO RNASelect Fluorescent Cell Staining er en cellepermeant nukleinsyrefarvning, der selektivt farver RNA. Selvom den stort set ikke er fluorescerende i fravær af nukleinsyrer, udviser farvningen en klar grøn fluorescens, når den SYTO RNASelect bindes til RNA (absorptions-/emissionsmaksimum ∼490/530 nm), men kun et svagt fluorescerende signal, når den bindes til DNA. Det er blevet brugt til farvning af RNA-last i exosomer i både levende celleprøver og isolerede exosomer.

SYTO Grønt fluorescerende Nukleinsyrefarve-plettningsprøvesæt

SYTO Green Fluorescent Nucleic Acid Stain Sampler Kit #1 indeholder vores samling af cellepermeante, grøn-fluorescerende SYTO nukleinsyrefarvninger. Da farvestofferne kan udvise forskellige farvningsadfærd med forskellige væv og celler, kan det være nødvendigt at teste farverne for at finde den optimale farve til en specifik anvendelse. Sættet indeholder 50 μl hver af SYTO 11 –14, 16, 21, 24 og 25 farvestoffer.

Enhver fysiologisk buffer mellem pH 7,0 –og 8,0, inklusive PBS, kan bruges til at fortynde SYTO farvestofferne til farvningsopløsningen.