Applied Biosystems™ RapidFinder™ STEC screeningsassay

De Applied Biosystems™ RapidFinder™ STEC Screening Assay er en del af en komplet, valideret screenings- og bekræftelsesarbejdsgang TaqMan™ PCR-påvisning i realtid af den Shiga-toksin-producerende E. coli (STEC) O157:H7 og Big 6 non-O157:H7 serogruppe (O26, O45, O103, O111, O121 og O145) i en række forskellige oksekødsprodukter. RapidFinder STEC-screeningsassayet blev udviklet sammen med USDA-ARS og indeholder 96 komplette qPCR-assays målrettet til at screene for Shiga-toksin 1 og 2 (stx1/stx2), eae og potentiel O157:H7-tilstedeværelse. Assayet er designet til at omfatte alle kendte allelvarianter af stx og eae, inklusive stx2g og stx2f. Alle reaktioner inkluderer en intern positiv kontrol (IPC ) og ROX™ passiv reference. Prøver vurderet som negative kræver ingen yderligere test. Prøver vurderet som positive skal testes yderligere ved hjælp af RapidFinder™ STEC-bekræftelsesanalyse .

RapidFinder STEC Detection Workflow giver:

Større tillid til resultater —en del af en valideret arbejdsgang til påvisning af så lidt som 1-5 CFU af patogen STEC i din prøve

Forenklet —arbejdsgang samtidig påvisning af E. coli O157:H7 og de store 6 ikke-O157:H7-stammer i 375 g oksekødsprøver med et lukket rør, et-trins frysetørret detektionsformat, der passer ind i dit eksisterende testprogram

Reduceret chance for falske —resultater gennem brug af højkvalitets DNA-præparat, proprietært assaydesign og intern positiv kontrol

Samme dag detektion af patogene STEC'er og clearance af STEC-negative oksekødsprøver på så lidt som 12 timer, hvilket understøtter tidlig produktfrigivelse

Minimerede omkostninger og laboratorieplads med brug af et mindre volumen af et ikke-proprietært enkelttrinsberigelsesmedium, hvilket eliminerer behovet for at købe proprietære medier

Kompatibilitet med RapidFinder™ Express-software v.1.2 og —senere muliggør nem, automatiseret tilstedeværelse/fravær detektion og fortolkning af resultater

. Undersøgelser har vist, at RapidFinder STEC-analyserne har et højt niveau af sensitivitet og specificitet for E. coli O157:H7 og Big 6 ikke-O157 STEC-stammerne* . De detekterede alle inklusionsstammer og viste ingen krydsreaktivitet med nogen af de testede eksklusionsstammer. Stx-assayene detekterede alle kendte varianter af stx1 og stx2, inklusive stx2f og stx2g. Den optimerede arbejdsgang, der blev udviklet sammen med USDA-ARS, viste detektion svarende til MLG-referencemetoden, og den interne positive kontrol i begge analyser reducerer risikoen for falsk-negative signifikant.

Applikationer
RapidFinder STEC Detection Workflow er beregnet til brug af mikrobiologiske analytikere, der skal teste for STEC i oksekødsprøver. Kombineret med Applied Biosystems 7500 Fast RT-PCR-system, RapidFinder STEC-screenings- og bekræftelsesassays giver en omfattende løsning til hurtig detektion, identifikation og bekræftelse af Big 6 STEC'er og E. coli 0157:H7 for at opfylde import- og eksportkrav til oksekødsindustrien. Specifikke arbejdsgange er beskrevet i figurerne nedenfor og inkluderer både automatiseret og spinsøjle-baseret DNA-isolering og real-time PCR-detektion af E. coli O157:H7 og Big 6 ikke-O157 stammer i oksekødsprøver.

RapidFinder Express Software Når den er
integreret i RapidFinder STEC Detection Workflow, automatiserer RapidFinder Express Software datafortolkning og genererer brugerinstruktioner om, hvordan man fortsætter med en prøve. Dataskærme er tilgængelige for nybegyndere og avancerede brugere, der viser simple tilstedeværelses-/fraværsopkald eller rådatafiler ved hjælp af 7500 Fast System SDS-software.

RapidFinder STEC screening og bekræftelsesassays opfylder USDA FSIS vejledning. RapidFinder STEC Detection Workflow, en to-trins realtids PCR-metode, er designet til nøjagtigt at detektere, identificere og bekræfte E. coli O157:H7 og de 6 store serogrupper af ikke-O157 Shiga-toksin-
producerende i USDA-koloni-producerende EFS-service, som er defineret som fødevareproducerende i USDA-kolonien. ægteskabsbrud i den amerikanske oksekødsindustri.

Lær mere om RapidFinder STEC Detection Workflow >

* Swimley, Michelle S. Design og evaluering af to-trins multipleks realtids PCR-metode til påvisning af O157:H7 og ikke-O157 STEC-stammer fra oksekødsprøver. IAFP 2015.