Applied Biosystems™ Protein Thermal Shift™ Software v1.4

Beskrivelse

Forskellige proteiner vil have forskellige Protein Thermal Shift™ profiler, hver med en unik proteinsmeltekurveform, hældning, signal-til-støj-forhold og temperatursmelteområde (se figuren til højre for et eksempel). De Protein Thermal Shift™ Software genererer en eller flere smeltetemperaturværdier (Tm) fra disse kurver ved to metoder: den Boltzmann-afledte Tm og den afledte kurve-bestemte Tm, for at tjene som sammenligningspunkter mellem kurverne og repræsentere den relative termiske stabilitet af proteinet under forskellige testbetingelser.

To metoder til generering af Tm-værdi
Boltzmann-metoden tilpasser dataene inden for et automatisk (eller manuelt) identificeret smelteområde til to-stats Boltzmann-modellen for at generere Tm. Typisk anvendes Boltzmann-metoden for proteiner med et enkelt smeltedomæne. For proteiner med flere smeltedomæner kan den afledte kurvemetode dog anvendes. Den afledte kurvemetode bruger en numerisk beregnet anden afledt af rådataene til at estimere de temperaturer, hvor der kan forekomme op til seks toppe (lokale maksima) i den afledede profil. En empirisk udledt tærskelværdi for signal-til-støj-forholdet bruges til at bestemme, hvilke lokale maksima der vil blive detekteret.

Kompatibel med vores realtids PCR-systemer
Protein Thermal Shift™ analysesoftware er kompatibel med kørefiler genereret fra disse realtids PCR-systemer: QuantStudioTM 3, 5, 6, 6 Pro, 7, 7 Pro og 12K Flex, StepOne™ , StepOnePlus™ , 7500, 7500 Fast og ViiA 7.™

Forbered dine prøver ved hjælp af vores Protein Thermal Shift™ Kits
Forbered dine prøver til analyse ved hjælp af vores Protein Thermal Shift™ Startsæt eller Protein Thermal Shift™ Dye Kit (tilgængelig separat). Disse kits giver brugerne mulighed for at anvende et farvestof, der binder til udsatte hydrofobe rester til at overvåge den termiske stabilitet af proteiner ved hjælp af et real-time PCR-instrument til at identificere bufferbetingelser, der stabiliserer proteinet af interesse, eller screene biblioteker af ligander for forbindelser, der binder proteinet af interesse.