Thermo Scientific™ Pierce™ TMT11plex Yeast Digest Standard

Pierce TMT11plex Yeast Digest Standard består af fire medfødte stammer af Saccharomyces cerevisiae (en parental linje, BY4741, og tre linjer, der mangler de ikke-essentielle proteiner Met6, His4 eller Ura2), mærket i tre eksemplarer (knock-out stammer) eller duplikat med TMT1-reagens-1 duplikat-mærke. Knock-out-stammerne bruges i kombination med forældrestammen for at muliggøre sammenligning af peptid- og proteinoverflod til kvantificering. Pierce TMT11plex Yeast Digest Standard:
•Praktisk —klar til brug frysetørret pulver præ-mærket med TMT11plex reagenser
•Kvalitetsgærstammer —verificeret for genotype, ækvimolær blanding af de TMT-mærkede stammer
•Kvantitativt mål —den kvantitative præcision af TMT reporter ioner for 11 kanaler
•Diagnostisk fremragende —QC-analyseværktøj til proteinkvantificering ved hjælp af TMT på LC-MS/MS instrumenter

Kvantitative proteomiske strategier ved hjælp af TMT reagenser muliggør multipleksing og præcis måling af proteinoverflod. Vellykket udførelse af TMT kvantificering omfatter optimeret kromatografi, massespektrometri (MS) og dataanalyse. En kritisk parameter for succes i denne arbejdsgang er evnen til konsekvent at opdage TMT fragmenter ioner på tværs af 11 kanaler til multipleksing. Vores TMT11plex Yeast Digest-standard er specielt designet til at vurdere LC-MS/MS-systemets ydeevne for TMT kvantificering, MS metodeoptimering og systemvalidering. Til metodeudvikling kan TMT11plex Yeast Digest Standard bruges til at måle nøjagtigheden, præcisionen og det dynamiske område af forskellige massespektrometri-tilgange. Disse standarder kan hjælpe med at optimere offline fraktionering, kromatografi, massespektrometriopsamling og dataanalyseindstillinger. Multifunktionelle applikationer, der anvender denne standard, reducerer inter-eksperimentvariabilitet for at give reproducerbar TMT kvantificering.

Referencer:
1. Paulo JA, O'Connell JD, Gygi SP . En tredobbelt knockout (TKO ) Proteomics Standard for diagnosticering af ioninterferens i isobariske mærkningseksperimenter. J Am Soc Mass Spectrom. 2016 10:1620-5.
2. Yang F, Shen Y, Camp DG 2nd, Smith RD. Høj-pH omvendt-fase kromatografi med fraktion sammenkædning til 2D proteomisk analyse. Ekspert Rev Proteomics . 2012 9(2):129-34.
3. Dayon L, Pasquarello C, Hoogland C, Sanchez JC, Scherl A. Kombination af lav- og højenergi tandemmassespektre til optimeret peptidkvantificering med isobariske tags. J Proteomics . 2010 73(4):769-77.
4. Diedrich JK, Pinto AF, Yates JR 3rd. Energiafhængighed af HCD på peptidfragmentering: trinvis kollisionsenergi finder det søde sted. J Am Soc Mass Spectrom. 2013 24(11):1690-9.
5. Chiva C, Sabidó E. HCD-only fragmenteringsmetode balancerer peptididentifikation og kvantificering af TMT-mærkede prøver i hybride lineære ionfælde/orbitrap-massespektrometre. J Proteomics . 2014 96:263-70.

Relaterede produkter:
Pierce HeLa Protein Digest Standard (Kat. nr. 88329)
Pierce Peptide Retentionstid Kalibreringsblanding (Kat. Nr. 88321)
TMT10plex isobarisk etiketreagenssæt plus TMT11-131C etiketreagens (kat.nr. A34808)