Thermo Scientific™ Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit

De Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit til Illumina Systems er designet til den robuste konstruktion af cDNA-biblioteker til strengspecifik RNA-sekventering Illumina næste generations sekvensering (NGS ) systemer. Modulerne samler de overlegne funktioner i SuperScript IV Reverse Transcriptase , Dynabeads magnetiske partikler og platin SuperFi DNA Polymerase, der gør det muligt for brugere at opnå sekventeringsklare biblioteker af høj kvalitet.

Denne Collibri Stranded RNA Library Prep Kit-moduler understøtter hurtig biblioteksforberedelse inden for 4,5 timer til mRNA- eller hele transkriptombiblioteker –med 1 25 ng mRNA-beriget eller ribodepleteret RNA-prøveinput. Multipleksing af biblioteker kan udføres ved hjælp af op til 96 enkeltindekserede eller unikke dobbeltindekserede primere, hvilket muliggør enkelt-læst eller parret ende-sekventering. Sættet er velegnet til RNA-prøver af forskellig kvalitet, inklusive FFPE-prøver.

Visuelle tegn på procesintegritet
For maksimal bekvemmelighed er visuelle tegn på procesintegritet inkluderet i hele bibliotekets forberedelsesworkflow. Overvåg udviklingen af biblioteksgenerering ved hjælp af visuel feedback fra farvestoffer i kritiske reagenser. Reaktionsblandingen skifter farve som reaktion på tilføjelsen af kritiske komponenter ved hvert trin for at sikre, at biblioteksforberedelse har den højeste chance for succes. De inerte farvestoffer interfererer ikke med enzymatiske reaktioner og kompromitterer ikke sekventeringsresultater.

Sådan virker det
Illumina-kompatible adaptere i fuld længde introduceres ved PCR-amplifikation ved hjælp af Platinum SuperFi DNA-polymerase til at konstruere enkeltindekserede eller unikke dobbeltindekserede biblioteker, der er kompatible med enkeltlæst eller parret ende-sekventering. Sættet indeholder 24 eller 96 enten enkeltindekserede stregkodede PCR-primere (i7) forblandet med en universel i5-primer eller unikke dobbeltindekserede PCR-primere, der muliggør multipleksing af op til 96 biblioteker. Optimerede oprydningstrin fjerner effektivt resterende primere og adapter/primer-dimere, mens høje biblioteksudbytter bevares.

Et relateret produkt, den Collibri Library Quantification Kit, anbefales til qPCR-baserede kvantificeringer af biblioteker, før du fortsætter til sekventering.

Ansøgninger
Den Collibri Stranded RNA Library Prep Kit anbefales til:
• Studier af genekspression
• Alternativ splejsningsanalyse
• Ikke-kodende RNA påvisning og opdagelse
• Identifikation af alternative polyadenyleringssteder
• Genfusionsdetektion
• Påvisning af transkriptisoformer