Thermo Scientific™ L-Proline til SILAC

Generelle egenskaber ved tunge og lette aminosyrer til SILAC mærkning:

• Effektiv—100% label-inkorporering i proteiner i levende celler
• Fleksible—forskellige isotoper af tunge og/eller lette aminosyrer for arginin, lysin, leucin og prolin muliggør kvantificering af peptider afledt af MS-grade proteaser
• Multiplex-funktioner—er tilgængelige med flere alternative isotoper af arginin og lysin, som muliggør analyse af flere behandlingsbetingelser i hvert eksperiment
• Kosttilskud—af høj kvalitet indeholder tunge aminosyrer med >99% isotoprenhed

Stabil isotopmærkning med aminosyrer i cellekultur (SILAC) er en kraftfuld metode til at identificere og kvantificere relative differentielle ændringer i komplekse proteinprøver. Denne tilgang indebærer in vivo metabolisk inkorporering af 'tunge' ¹³C- eller ¹⁵N-mærkede aminosyrer i proteiner efterfulgt af massespektrometri (MS) for accelereret og omfattende identifikation, karakterisering og kvantificering af proteiner.

Thermo Scientific Tunge og lette aminosyrer SILAC bruges sammen med specialiserede cellekulturmedier, der mangler essentielle aminosyrer. Tungt og let L-lysin samt L-arginin er de mest almindelige aminosyrer, der bruges til SILAC analyse af tryptiske peptider. Op til tre forskellige eksperimentelle betingelser kan let analyseres med forskellige isotoper af lysin og arginin. Til lysin tre-plex eksperimenter bruges 4,4,5,5-D₄ L-lysin og ¹³C₆ ¹⁵N₂ L-lysin til at generere peptider med henholdsvis 4- og 8-Da masseskift, sammenlignet med peptider genereret med let lysin. For arginin tre-plex eksperimenter bruges ¹³C₆ L-arginin og ¹³C₆ ¹⁵N₄ L-arginin til at generere peptider med henholdsvis 6- og 10-Da masseskift, sammenlignet med peptider genereret med let arginin. L-leucin er en anden aminosyre, der ofte bruges til SILAC mærkning, fordi det er en af de mest almindelige aminosyrer i proteinsekvenser. Prolin er en ikke-essentiel aminosyre, der nogle gange tilsættes medier SILAC for at forhindre metabolisk omdannelse af tung arginin til tung prolin i pattedyrscellelinjer med høj aktivitet af arginindehydrogenase.

Relaterede produkter

• L-Arginin-HCl for SILAC (Kat. Nr. 89989)
• L-Leucin for SILAC (Kat. Nr. 88428)
• L-Lysine-2HCl for SILAC (Kat. Nr. 89987)