Applied Biosystems™ TaqPath™ ProAmp™ Master Mix

Designet til multiplex SNP-genotypning

En TaqMan™ SNP Genotyping Assay retter sig mod et enkelt SNP-locus (en specifik genomisk position) og inkluderer to PCR-primere og to allele-specifikke prober. Hver probe hybridiserer til det samme genomiske område, men adskiller sig med ét nukleotid, hvilket muliggør påvisning af et af de to mulige alleler på det locus. Dette design muliggør alleldiskrimination inden for en enkelt qPCR-reaktion.

TaqPath™ ProAmp™ Master Mix understøtter singleplex- og multiplex SNP-genotypning, inklusive 2-SNP multiplex-konfigurationer (to SNP-loci pr. reaktion; fire allele-specifikke prober i alt). Denne multiplexing-metode øger dataoutput pr. prøve, samtidig med at den opretholder sikker alleldiskrimination og assay-præstation.

Seks SNP-loci pr. reaktionsmultipleksing kræver en specialformulering TaqPath ProAmp uden ROX.

Fordele ved TaqPath™ ProAmp™ Master Mix

• Enestående datakvalitet—, høj specificitet, reproducerbarhed og dynamisk område* for SNP-genotyping og CNV-analyse
• Hæmmertolerance—robust ydeevne med prøver fra blod, mundprøver og kortstansere
• Optimeret til SNP-genotypning fra rå lysater—understøtter nøjagtig SNP-genotypning uden DNA-rensning
• 72-timers pre-PCR bordstabilitet med renset DNA—, ideelt til automatiserede og højkapacitetsarbejdsgange, muliggjort af den proprietære Dual-Lock™ Taq DNA-hotstart-mekanisme
• Multiplex-fleksibilitet—understøtter singleplex til fire-måls SNP-detektion pr. reaktion
• Produktionskonsistens—produceret i en ISO 13485-certificeret facilitet
• Overholdelsespakken indeholder—ofte forespurgt kvalitets- og regulatorisk dokumentation

Præcis SNP-genotypning fra renset DNA eller rå lysater

TaqPath™ ProAmp™ Master Mix leverer nøjagtige og reproducerbare SNP-genotypningsresultater fra enten renset genomisk DNA eller rå lysatinput. Når det kombineres med DNA Extract All™ Reagents Kit, understøtter masterblandingen robust singleplex- og 2-locus multiplex SNP-genotypning direkte fra rå lysater fremstillet fra blod- og buccale podninger.

Intern test viste 100% overensstemmelse mellem SNP-genotypekald opnået fra rå lysater og renset genomisk DNA ved brug af udvalgte 2-SNP multiplex assay-konfigurationer, hvilket bekræftede pålidelig alleldiskrimination uden DNA-rensning.

Præcis SNP-genotypning fra primitive lysater med forbedret ydeevne sammenlignet med alternative mastermixes

I interne evalueringer med TaqMan™ SNP Genotyping Assays og rå blodlysater TaqPath™ ProAmp™ viste Master Mix forbedret nøjagtighed af SNP-genotypekald og klarere alleldiskrimination sammenlignet med udvalgte alternative qPCR masterblandinger. Formuleringen gav tæt genotype-klyngeadskillelse og konsistente SNP-locuskald på tværs af replikater, hvilket understøttede sikker genotypningspræstation selv i nærvær af inhibitorer, der ofte findes i biologiske prøver.

Højpræcis kopinummervariationsanalyse (CNV)

Ud over SNP-genotypning understøtter Master Mix nøjagtig copy number variation (CNV)-analyse, TaqPath™ ProAmp™ når det bruges med renset genomisk DNA. Rå lysatprøve anbefales ikke til CNV-analyse.

Formuleringen muliggør pålidelig bestemmelse af kopiantal på tværs af flere genmål, herunder CYP2D6 intron 2 og CYP2D6 intron 6, med nøjagtig kvantificering i prøver med en til fire kopier. Interne sammenligninger viste forbedret præcision og reproducerbarhed af kopiantal sammenlignet med udvalgte alternative qPCR-masterblandinger, hvor renset genomisk DNA blev brugt som input.

En del af en strømlinet Sample-to-Genotype arbejdsgang

TaqPath™ ProAmp™ Master Mix integreres sømløst i en komplet Sample-to-Genotype arbejdsgang, inklusive:

• DNA-ekstrakt All™ reagenssæt til hurtig fremstilling af rå lysater til SNP-genotyping
• TaqMan™ Foruddesignede SNP genotyping assays eller TaqMan™ DME genotyping assays
• Renset genomisk DNA til analyse af kopinummervariation
• QuantStudio™ Real-time PCR-instrumenter
• Diomni™ Design- og analysesoftware til dataanalyse af multiplexgenotyping

Denne arbejdsgang muliggør hurtigere behandling og reducerer hands-on tid for SNP-genotypning, samtidig med at den understøtter præcis CNV-analyse ved brug af renset DNA , når det er nødvendigt.

Generelle reagenser fremstillet under cGMP

TaqPath™ masterblandinger er generelle reagenser mærket til laboratoriebrug og fremstilles i en ISO 13485-certificeret og FDA-registreret facilitet, der følger gældende principper for god fremstillingspraksis (cGMP).

Overholdelsespakke

Ofte efterspurgte overholdelsesdokumenter er tilgængelige, herunder:

• Kvalitetserklæring, der beskriver overholdelse af cGMP
• Parti-specifikt analysecertifikat (COA)
• Produktstabilitetserklæring
• Dokumentation for leverandørevalueringsstøtte
• Gennemført selvevaluering
• ISO Certifikater efter produktionssted
• BSE/TSE-erklæring
• Ændringskontrol og registrering af notifikationer

For forespørgsler relateret til EU REACH-overholdelse, send en e-mail til LSGChemicalCompliance@thermofisher.com.

Finder du ikke det dokument, du har brug for? Teknisk support er tilgængelig for at hjælpe.

* Dynamisk område afhænger af assay-design, skabelonkoncentration og mastermix-formulering; Resultaterne kan variere fra individ.